زمینه و هدف: امروزه، پلیمورفیسمهای تک نوکلئوتیدی غیرمترادف (nsSNPs) ، که سبب تغییر در عملکرد پروتئینها میگردند را بعنوان مارکرهایی در جهت شناسایی پروتئینهای درگیر در بیماریهای انسانی و سرطانها بکار میبرند.
روش کار: در این مطالعه، به جهت بررسی تأثیر عملکردی nsSNP ها در ناحیهی کدکنندهی آنزیم COX-۲ ، توالی نوکلئوتیدی این آنزیم از طریق پایگاه اطلاعاتی NCBI با رکورد (gi|۲۲۳۹۴۱۹۰۹) به همراه تمام SNP های گزارش شده موجود (۲۸۳ مورد) در این پایگاه برای سرطانهای مختلف جمعآوری گردید و توسط سرورهای SIFT ، I-Mutant ۲,۰ ، SNP & GO ، PANTHER و FASTSNP مورد آنالیز قرار گرفت. این سرورها، ابزارهایی در جهت پیشبینی اثر جایگزینیهای اسیدآمینهی بر عملکرد، پایداری و قدرت بیماریزایی پروتئینها به حساب میآیند.
یافتهها: COX-۲ آنزیمی اساسی در سنتز پروستاگلاندینها و بروز التهاب میباشد که نقش آن در ایجاد و گسترش انواع سرطان به اثبات رسیده است. طبق نتایج بدست آمده در این مطالعه، همهی جایگزینیهای موجود در پایگاه اطلاعاتی NCBI سبب تغییر در عملکرد و پایداری پروتئین COX-۲ نمیگردد و برخی از جایگزینیهای اسیدآمینه ای شامل R۲۲۸H و S۴۲۸A است که با ایجاد تغییر در عملکرد و پایداری پروتئین COX-۲ بطور قطع میتوانند در ایجاد و گسترش بسیاری از انواع سرطانها نقشی اساسی را ایفا کنند.
نتیجهگیری: جایگزینیهای اسیدآمینهی COX-۲ بعنوان عامل بسیار مهمی در زمینهی�ابتلا به بیماری های مختلف به ویژه سرطانها به شمار میآیند. جایگزینیهای غیرمترادفی که در دومن کاتالیتیک رخ میدهند به جهت تغییر در فعالیت آنزیم از اهمیت ویژهای نسبت به سایر نواحی برخوردارند و از آنها میتوان بعنوان مارکری مستقیم برای شناسایی هرچه سریعتر زمینهی ابتلا به بیماریهای مختلف استفاده نمود.